scientific-writing

Capacités essentielles

1. Structure et organisation du manuscrit

Format IMRAD : Guider les articles à travers la structure standard Introduction, Méthodes, Résultats et Discussion utilisée dans la plupart des disciplines scientifiques. Cela inclut :

• Introduction : Établir le contexte de la recherche, identifier les lacunes, énoncer les objectifs
• Méthodes : Détailler la conception de l'étude, les populations, les procédures et les approches analytiques
• Résultats : Présenter les résultats de manière objective sans interprétation
• Discussion : Interpréter les résultats, reconnaître les limites, proposer des directions futures

Pour des conseils détaillés sur la structure IMRAD, consultez references/imrad_structure.md.

Structures alternatives : Soutenir les formats spécifiques aux disciplines, notamment :

• Articles de synthèse (narratifs, systématiques, portée)
• Rapports de cas et séries de cas
• Méta-analyses et analyses groupées
• Articles théoriques/de modélisation
• Articles méthodologiques et protocoles

2. Conseils de rédaction spécifiques aux sections

Composition du résumé : Rédiger des synthèses concises et autonomes (100-250 mots) qui capturent l'objectif, les méthodes, les résultats et les conclusions de l'article. Soutenir à la fois les résumés structurés (avec sections étiquetées) et les formats non structurés en un seul paragraphe.

Développement de l'introduction : Construire des introductions convaincantes qui :

• Établissent l'importance du problème de recherche
• Examinent systématiquement la littérature pertinente
• Identifient les lacunes ou controverses en matière de connaissances
• Énoncent clairement les questions de recherche ou les hypothèses
• Expliquent la nouveauté et l'importance de l'étude

Documentation des méthodes : Assurer la reproductibilité par :

• Descriptions détaillées des participants/échantillons
• Documentation claire des procédures
• Méthodes statistiques avec justification
• Spécifications des équipements et matériaux
• Déclarations d'approbation éthique et de consentement

Présentation des résultats : Présenter les résultats avec :

• Flux logique des résultats primaires aux secondaires
• Intégration avec les figures et tableaux
• Signification statistique avec tailles d'effet
• Rapprochement objectif sans interprétation

Construction de la discussion : Synthétiser les résultats en :

• Reliant les résultats aux questions de recherche
• Comparant avec la littérature existante
• Reconnaissant honnêtement les limites
• Proposant des explications mécanistes
• Suggérant des implications pratiques et des recherches futures

3. Gestion des citations et des références

Appliquer correctement les styles de citation dans les disciplines. Pour des guides de style complets, consultez references/citation_styles.md.

Principaux styles de citation :

• AMA (American Medical Association) : Citations numérotées en exposant, courantes en médecine
• Vancouver : Citations numérotées entre crochets, standard biomédical
• APA (American Psychological Association) : Citations auteur-date dans le texte, courantes en sciences sociales
• Chicago : Notes-bibliographie ou auteur-date, sciences humaines et sciences
• IEEE : Crochets numérotés, ingénierie et informatique

Bonnes pratiques :

• Citer les sources primaires si possible
• Inclure la littérature récente (cinq à dix ans dernières pour les domaines actifs)
• Équilibrer la distribution des citations entre introduction et discussion
• Vérifier toutes les citations par rapport aux sources originales
• Utiliser un logiciel de gestion des références (Zotero, Mendeley, EndNote)

4. Figures et tableaux

Créer des visualisations de données efficaces qui améliorent la compréhension. Pour des bonnes pratiques détaillées, consultez references/figures_tables.md.

Quand utiliser des tableaux plutôt que des figures :

• Tableaux : Données numériques précises, ensembles de données complexes, variables multiples nécessitant des valeurs exactes
• Figures : Tendances, motifs, relations, comparaisons mieux comprises visuellement

Principes de conception :

• Rendre chaque tableau/figure auto-explicatif avec des légendes complètes
• Utiliser un formatage et une terminologie cohérents dans tous les éléments d'affichage
• Étiqueter tous les axes, colonnes et lignes avec des unités
• Inclure les tailles d'échantillon (n) et les annotations statistiques
• Suivre la ligne directrice « un tableau/figure pour 1 000 mots »
• Éviter de dupliquer les informations entre le texte, les tableaux et les figures

Types de figures courants :

• Graphiques en barres : Comparaison de catégories distinctes
• Graphiques linéaires : Montrer les tendances dans le temps
• Nuages de points : Afficher les corrélations
• Diagrammes en boîte : Montrer les distributions et les valeurs aberrantes
• Cartes thermiques : Visualiser les matrices et les motifs

5. Directives de rapprochement par type d'étude

Assurer la complétude et la transparence en suivant les normes de rapprochement établies. Pour les détails complets des lignes directrices, consultez references/reporting_guidelines.md.

Lignes directrices clés :

• CONSORT : Essais contrôlés randomisés
• STROBE : Études observationnelles (cohorte, cas-témoins, transversale)
• PRISMA : Revues systématiques et méta-analyses
• STARD : Études de précision diagnostique
• TRIPOD : Études de modèles de prédiction
• ARRIVE : Recherche animale
• CARE : Rapports de cas
• SQUIRE : Études d'amélioration de la qualité
• SPIRIT : Protocoles d'étude pour essais cliniques
• CHEERS : Évaluations économiques

Chaque ligne directrice fournit des listes de contrôle garantissant que tous les éléments méthodologiques critiques sont rapportés.

6. Principes et style de rédaction

Appliquer les principes fondamentaux de la rédaction scientifique. Pour des conseils détaillés, consultez references/writing_principles.md.

Clarté :

• Utiliser un langage précis et sans ambiguïté
• Définir les termes techniques et les abréviations à leur première utilisation
• Maintenir un flux logique dans et entre les paragraphes
• Utiliser la voix active le cas échéant pour la clarté

Concision :

• Éliminer les mots et phrases redondants
• Préférer les phrases plus courtes (en moyenne 15-20 mots)
• Supprimer les qualificatifs inutiles
• Respecter strictement les limites de mots

Précision :

• Rapporter les valeurs exactes avec la précision appropriée
• Utiliser une terminologie cohérente dans l'ensemble
• Distinguer entre les observations et les interprétations
• Reconnaître l'incertitude de manière appropriée

Objectivité :

• Présenter les résultats sans biais
• Éviter de surestimer les résultats ou les implications
• Reconnaître les preuves contradictoires
• Maintenir un ton professionnel et neutre

7. Processus de rédaction : De l'esquisse aux paragraphes complets

CRITIQUE : Toujours écrire en paragraphes complets, jamais soumettre de points à puces dans les articles scientifiques.

Les articles scientifiques doivent être rédigés en prose complète et fluide. Utiliser cette approche en deux étapes pour une rédaction efficace :

Étape 1 : Créer des esquisse de section avec points clés

Quand démarrer une nouvelle section :

1. Utiliser la compétence de recherche pour rassembler la littérature et les données pertinentes
2. Créer une esquisse structurée avec des points à puces marquant :
   • Les arguments ou résultats principaux à présenter
   • Les études clés à citer
   • Les points de données et les statistiques à inclure
   • Le flux logique et l'organisation
3. Ces points à puces servent de support — ce ne sont PAS le manuscrit final

Exemple d'esquisse (section Introduction) :

- Arrière-plan : L'IA en découverte de médicaments gagne du terrain
  * Citer les récentes revues (Smith 2023, Jones 2024)
  * Les méthodes traditionnelles sont lentes et coûteuses
- Lacune : Application limitée aux maladies rares
  * Seulement 2 études antérieures (Lee 2022, Chen 2023)
  * Les petits ensembles de données restent un défi
- Notre approche : Apprentissage par transfert à partir de maladies courantes
  * Architecture nouvelle combinant X et Y
- Objectifs de l'étude : Valider sur 3 ensembles de données de maladies rares

Étape 2 : Convertir les points clés en paragraphes complets

Une fois l'esquisse complétée, développer chaque point à puces en prose appropriée :

1. Transformer les points à puces en phrases complètes avec sujets, verbes et compléments
2. Ajouter des transitions entre les phrases et les idées (cependant, de plus, au contraire, par la suite)
3. Intégrer les citations naturellement dans les phrases, pas sous forme de listes
4. Développer avec le contexte et les explications que les points à puces omettent
5. Assurer le flux logique d'une phrase à l'autre dans chaque paragraphe
6. Varier la structure des phrases pour maintenir l'engagement du lecteur

Exemple de conversion en prose :

Les approches d'intelligence artificielle ont gagné une traction significative dans 
les pipelines de découverte de médicaments au cours de la dernière décennie (Smith, 
2023 ; Jones, 2024). Bien que ces méthodes informatiques montrent de la promesse pour 
accélérer l'identification de candidats thérapeutiques, les approches expérimentales 
traditionnelles restent lentes et consommatrices de ressources, nécessitant souvent 
des années de travaux de laboratoire et un investissement financier substantiel. 
Cependant, l'application de l'IA aux maladies rares a été limitée, avec seulement 
deux études antérieures démontrant des résultats de preuve de concept (Lee, 2022 ; 
Chen, 2023). L'obstacle principal a été la rareté des données d'entraînement pour 
les conditions affectant de petites populations de patients.

Pour relever ce défi, nous avons développé une approche d'apprentissage par transfert 
qui exploite les connaissances des maladies courantes bien caractérisées pour prédire 
les cibles thérapeutiques pour les conditions rares. Notre architecture neuronale 
nouvelle combine les couches convolutives pour l'extraction de caractéristiques 
moléculaires avec les mécanismes d'attention pour la modélisation des interactions 
protéine-ligand. L'objectif de cette étude était de valider notre approche sur trois 
ensembles de données de maladies rares indépendants, évaluant à la fois la précision 
prédictive et l'interprétabilité biologique des résultats.

Différences clés entre esquisses et texte final :

Erreurs courantes à éviter :

• ❌ Ne jamais laisser de points à puces dans le manuscrit final
• ❌ Ne jamais soumettre de listes où devraient être des paragraphes
• ❌ Ne pas utiliser de listes numérotées ou à puces dans les sections Résultats ou Discussion (sauf pour des cas spécifiques comme les hypothèses d'étude ou les critères d'inclusion)
• ❌ Ne pas écrire de fragments de phrase ou de pensées incomplètes
• ✅ À faire : Utiliser occasionnellement des listes uniquement dans Méthodes (par exemple, critères d'inclusion/d'exclusion, listes de matériaux)
• ✅ À faire : S'assurer que chaque section s'écoule en prose connectée
• ✅ À faire : Lire les paragraphes à haute voix pour vérifier le flux naturel

Quand les listes SONT acceptables (cas limités) :

Les listes ne peuvent apparaître dans les articles scientifiques que dans des contextes spécifiques :

• Méthodes : Critères d'inclusion/d'exclusion, matériaux et réactifs, caractéristiques des participants
• Matériaux supplémentaires : Protocoles étendus, listes d'équipements, paramètres détaillés
• Jamais dans : Résumé, Introduction, Résultats, Discussion, Conclusions

Règle de format du résumé :

• ❌ JAMAIS utiliser de sections étiquetées (Arrière-plan :, Méthodes :, Résultats :, Conclusions :)
• ✅ TOUJOURS écrire en paragraphe(s) fluide(s) avec transitions naturelles
• Exception : Utiliser le format structuré uniquement si le journal l'exige explicitement dans les directives aux auteurs

Intégration avec la recherche :

La compétence de recherche est essentielle pour l'étape 1 (création d'esquisses) :

1. Chercher les articles pertinents en utilisant la recherche
2. Extraire les résultats clés, les méthodes et les données
3. Organiser les résultats en points à puces dans votre esquisse
4. Puis convertir l'esquisse en paragraphes complets à l'étape 2

Ce processus en deux étapes vous assure que vous :

• Rassemblez et organisez les informations systématiquement
• Créez une structure logique avant la rédaction
• Produisez de la prose polie et prête pour la publication
• Maintenez l'accent sur le flux narratif

8. Formatage des rapports professionnels (documents non-revue)

Pour les rapports de recherche, rapports techniques, livres blancs et autres documents professionnels qui NE SONT PAS des manuscrits de revue, utiliser le package de style LaTeX scientific_report.sty pour une apparence polie et professionnelle.

Quand utiliser le formatage des rapports professionnels :

• Rapports de recherche et rapports techniques
• Livres blancs et notes politiques
• Rapports de subvention et rapports de progression
• Rapports d'industrie et documentation technique
• Résumés de recherche internes
• Études de faisabilité et livrables de projet

Quand NE PAS utiliser (utiliser plutôt le formatage spécifique au lieu) :

• Manuscrits de revue → Utiliser la compétence venue-templates
• Articles de conférence → Utiliser la compétence venue-templates
• Thèses académiques → Utiliser les modèles institutionnels

Le package de style scientific_report.sty fournit :

Environnements de boîte pour l'organisation du contenu :

% Conclusions clés (bleu) - pour les découvertes majeures
\begin{keyfindings}[Titre]
Contenu avec les conclusions clés et les statistiques.
\end{keyfindings}

% Méthodologie (vert) - pour la mise en évidence des méthodes
\begin{methodology}[Conception de l'étude]
Description des méthodes et procédures.
\end{methodology}

% Recommandations (violet) - pour les points d'action
\begin{recommendations}[Implications cliniques]
\begin{enumerate}
    \item Recommandation spécifique 1
    \item Recommandation spécifique 2
\end{enumerate}
\end{recommendations}

% Limites (orange) - pour les avertissements et mises en garde
\begin{limitations}[Limites de l'étude]
Description des limites et de leurs implications.
\end{limitations}

Formatage professionnel des tableaux :

\begin{table}[htbp]
\centering
\caption{Résumé des résultats}
\begin{tabular}{@{}lccc@{}}
\toprule
\textbf{Variable} & \textbf{Traitement} & \textbf{Contrôle} & \textbf{p} \\
\midrule
Résultat 1 & \meansd{42,5}{8,3} & \meansd{35,2}{7,9} & <,001\sigthree \\
\rowcolor{tablealt} Résultat 2 & \meansd{3,8}{1,2} & \meansd{3,1}{1,1} & ,012\sigone \\
Résultat 3 & \meansd{18,2}{4,5} & \meansd{17,8}{4,2} & ,58\signs \\
\bottomrule
\end{tabular}

{\small \siglegend}
\end{table}

Commandes de notation scientifique :

Pour commencer :

\documentclass[11pt,letterpaper]{report}
\usepackage{scientific_report}

\begin{document}
\makereporttitle
    {Titre du rapport}
    {Sous-titre}
    {Nom de l'auteur}
    {Institution}
    {Date}

% Votre contenu avec formatage professionnel
\end{document}

Compilation : Utiliser XeLaTeX ou LuaLaTeX pour un rendu correct de la police Helvetica :

xelatex report.tex

Pour une documentation complète, consultez :

• assets/scientific_report.sty : Le package de style
• assets/scientific_report_template.tex : Exemple de modèle complet
• assets/REPORT_FORMATTING_GUIDE.md : Guide de référence rapide
• references/professional_report_formatting.md : Guide de formatage complet

9. Formatage spécifique aux revues

Adapter les manuscrits aux exigences de la revue :

• Suivre les directives aux auteurs pour la structure, la longueur et le format
• Appliquer les styles de citation spécifiques à la revue
• Respecter les spécifications des figures/tableaux (résolution, formats de fichier, dimensions)
• Inclure les déclarations requises (financement, conflits d'intérêts, disponibilité des données, approbation éthique)
• Respecter les limites de mots pour chaque section
• Formater selon les exigences du modèle quand fourni

10. Langage et terminologie spécifiques au domaine

Adapter le langage, la terminologie et les conventions pour correspondre à la discipline scientifique spécifique. Chaque domaine a un vocabulaire établi, des formulations préférées et des conventions spécifiques au domaine qui signalent l'expertise et assurent la clarté pour le public cible.

Identifier les conventions linguistiques spécifiques au domaine :

• Examiner la terminologie utilisée dans les articles récents à haut impact dans la revue cible
• Noter les abréviations, unités et systèmes de notation spécifiques au domaine
• Identifier les termes préférés (par exemple, « participants » vs « sujets », « composé » vs « médicament », « spécimens » vs « échantillons »)
• Observer comment les méthodes, organismes ou techniques sont généralement décrits

Sciences biomédicales et cliniques :

• Utiliser une terminologie anatomique et clinique précise (par exemple, « infarctus du myocarde » et non « crise cardiaque » dans la rédaction formelle)
• Suivre la nomenclature standardisée des maladies (CIM, DSM, SNOMED-CT)
• Spécifier les noms de médicaments en utilisant d'abord les noms génériques, les noms de marque entre parenthèses si nécessaire
• Utiliser « patients » pour les études cliniques, « participants » pour la recherche communautaire
• Suivre la nomenclature de la Human Genome Variation Society (HGVS) pour les variantes génétiques
• Rapporter les valeurs de laboratoire avec des unités standard (unités SI dans la plupart des revues internationales)

Biologie moléculaire et génétique :

• Utiliser l'italique pour les symboles de gènes (par exemple, TP53), la police normale pour les protéines (par exemple, p53)
• Suivre la nomenclature des gènes spécifique à l'espèce (majuscules pour l'homme : BRCA1 ; minuscules pour la souris : Brca1)
• Spécifier les noms d'organismes en entier à la première mention, puis utiliser les abréviations acceptées (par exemple, Escherichia coli, puis E. coli)
• Utiliser la notation génétique standard (par exemple, +/+, +/-, -/- pour les génotypes)
• Utiliser la terminologie établie pour les techniques moléculaires (par exemple, « réaction en chaîne par polymérase quantitative » ou « qPCR », non « PCR en temps réel »)

Chimie et sciences pharmaceutiques :

• Suivre la nomenclature IUPAC pour les composés chimiques
• Utiliser les noms systématiques pour les composés nouveaux, les noms courants pour les substances connues
• Spécifier les structures chimiques en utilisant la notation standard (par exemple, SMILES, InChI pour les bases de données)
• Rapporter les concentrations avec les unités appropriées (mM, μM, nM, ou % m/v, v/v)
• Décrire les voies de synthèse en utilisant la nomenclature de réaction acceptée
• Utiliser les termes « biodisponibilité », « pharmacocinétique », « CI50 » de manière cohérente avec les définitions du domaine

Écologie et sciences de l'environnement :

• Utiliser la nomenclature binomiale pour les espèces (italique : Homo sapiens)
• Spécifier les autorités taxonomiques à la première mention d'espèce quand pertinent
• Utiliser les classifications standardisées d'habitat et d'écosystème
• Utiliser une terminologie cohérente pour les métriques écologiques (par exemple, « richesse spécifique », « indice de diversité de Shannon »)
• Décrire les méthodes d'échantillonnage avec les termes standard du domaine (par exemple, « transect », « quadrat », « marquage-recapture »)

Physique et ingénierie :

• Suivre systématiquement les unités SI sauf si les conventions du domaine le dictent autrement
• Utiliser la notation standard pour les quantités physiques (scalaires vs vecteurs, tenseurs)
• Utiliser la terminologie établie pour les phénomènes (par exemple, « intrication quantique », « écoulement laminaire »)
• Spécifier l'équipement avec les numéros de modèle et les fabricants le cas échéant
• Utiliser la notation mathématique cohérente avec les normes du domaine (par exemple, ℏ pour la constante de Planck réduite)

Neurosciences :

• Utiliser la nomenclature standardisée des régions du cerveau (par exemple, se référer à des atlas comme Allen Brain Atlas)
• Spécifier les coordonnées pour les régions du cerveau en utilisant les systèmes stéréotaxiques établis
• Suivre les conventions de la terminologie neuronale (par exemple, « potentiel d'action » et non « décharge » dans la rédaction formelle)
• Utiliser « activité neuronale », « décharge neuronale », « activation cérébrale » convenablement selon la méthode de mesure
• Décrire les techniques d'enregistrement avec une spécificité appropriée (par exemple, « patch clamp en cellule entière », « enregistrement extracellulaire »)

Sciences sociales et comportementales :

• Utiliser un langage en priorité à la personne le cas échéant (par exemple, « personnes atteintes de schizophrénie » et non « schizophrènes »)
• Utiliser les construits psychologiques standardisés et les noms d'évaluation validés
• Suivre les directives de l'APA pour réduire les biais dans le langage
• Spécifier les cadres théoriques en utilisant la terminologie établie
• Utiliser « participants » plutôt que « sujets » pour la recherche humaine

Principes généraux :

Adapter l'expertise du public :

• Pour les revues spécialisées : Utiliser librement la terminologie spécifique au domaine, définir uniquement les termes très spécialisés ou nouveaux
• Pour les revues à large impact (par exemple, Nature, Science) : Définir plus de termes techniques, fournir du contexte pour les concepts spécialisés
• Pour les publics interdisciplinaires : Équilibrer la précision avec l'accessibilité, définir les termes à la première utilisation

Définir les termes techniques stratégiquement :

• Définir les abréviations à la première utilisation : « acide ribonucléique messager (ARNm) »
• Fournir des explications brèves pour les techniques spécialisées lors de la rédaction pour des publics plus larges
• Éviter de sur-définir les termes bien connus du public cible (indique une manque de familiarité avec le domaine)
• Créer un glossaire si de nombreux termes spécialisés sont inévitables

Maintenir la cohérence :

• Utiliser le même terme pour le même concept dans l'ensemble (ne pas alterner entre « médicament », « drogue » et « produit pharmaceutique »)
• Suivre un système cohérent pour les abréviations (décider de « PCR » ou « réaction en chaîne par polymérase » après la première définition)
• Appliquer le même système de nomenclature dans l'ensemble (particulièrement pour les gènes, les espèces, les produits chimiques)

Éviter les erreurs de mélange de domaines :

• Ne pas utiliser la terminologie clinique pour la science de base (par exemple, ne pas appeler les souris des « patients »)
• Éviter les colloquialismes ou les termes trop généraux à la place de la terminologie précise du domaine
• Ne pas importer la terminologie de domaines adjacents sans assurer une utilisation appropriée

Vérifier l'utilisation de la terminologie :

• Consulter les guides de style spécifiques au domaine et les ressources de nomenclature
• Vérifier comment les termes sont utilisés dans les articles récents de la revue cible
• Utiliser les bases de données et ontologies spécifiques au domaine (par exemple, Gene Ontology, termes MeSH)
• En cas de doute, citer une référence clé qui établit la terminologie

11. Pièges courants à éviter

Principales raisons de rejet :

1. Statistiques inappropriées, incomplètes ou insuffisamment décrites
2. Sur-interprétation des résultats ou conclusions non soutenues
3. Méthodes mal décrites affectant la reproductibilité
4. Échantillons petits, biaisés ou inappropriés
5. Qualité de rédaction médiocre ou texte difficile à suivre
6. Revue de littérature inadéquate ou contexte insuffisant
7. Figures et tableaux peu clairs ou mal conçus
8. Défaut de suivi des directives de rapprochement

Problèmes de qualité de rédaction :

• Mélange inapproprié des temps (utiliser le passé pour les méthodes/résultats, le présent pour les faits établis)
• Jargon excessif ou acronymes non définis
• Sauts de paragraphe qui perturbent le flux logique
• Transitions manquantes entre sections
• Notation ou terminologie incohérente

Processus de développement du manuscrit

Étape 1 : Planification

1. Identifier la revue cible et examiner les directives aux auteurs
2. Déterminer la directive de rapprochement applicable (CONSORT, STROBE, etc.)
3. Esquisser la structure du manuscrit (généralement IMRAD)
4. Planifier les figures et tableaux comme l'épine dorsale du document

Étape 2 : Rédaction (Utiliser le processus de rédaction en deux étapes pour chaque section)

1. Commencer par les figures et tableaux (l'histoire de données principale)
2. Pour chaque section ci-dessous, suivre le processus en deux étapes :
   • D'abord : Créer une esquisse avec des points à puces en utilisant la recherche
   • Ensuite : Convertir les points à puces en paragraphes complets avec de la prose fluide
3. Rédiger les méthodes (souvent les plus faciles à rédiger d'abord)
4. Rédiger les résultats (décrivant les figures/tableaux objectivement)
5. Composer la discussion (interprétation des résultats)
6. Écrire l'introduction (établissant la question de recherche)
7. Rédiger le résumé (synthétisant l'histoire complète)
8. Créer le titre (concis et descriptif)

Rappel : Les points à puces sont uniquement pour la planification — le manuscrit final doit être en paragraphes complets.

Étape 3 : Révision

1. Vérifier le flux logique et le « fil conducteur » dans l'ensemble
2. Vérifier la cohérence de la terminologie et de la notation
3. S'assurer que les figures/tableaux sont auto-explicatifs
4. Confirmer l'adhérence aux directives de rapprochement
5. Vérifier que toutes les citations sont exactes et correctement formatées
6. Vérifier les limites de mots pour chaque section
7. Corriger pour la grammaire, l'orthographe et la clarté

Étape 4 : Préparation finale

1. Formater selon les exigences de la revue
2. Préparer les matériaux supplémentaires
3. Écrire la lettre de présentation mettant en avant la signification
4. Compléter les listes de contrôle de soumission
5. Rassembler toutes les déclarations et formulaires requis

Intégration avec d'autres compétences scientifiques

Cette compétence fonctionne efficacement avec :

• Compétences d'analyse de données : Pour générer les résultats à rapporter
• Analyse statistique : Pour déterminer les présentations statistiques appropriées
• Compétences de revue de littérature : Pour contextualiser la recherche
• Outils de création de figures : Pour développer des visualisations prêtes pour la publication
• Compétence venue-templates : Pour les styles de rédaction spécifiques au lieu (manuscrits de revue)
• scientific_report.sty : Pour les rapports professionnels, livres blancs et documents techniques

Rapports professionnels vs manuscrits de revue

Choisir l'approche de formatage appropriée :

Styles de rédaction spécifiques au lieu

Avant de rédiger pour un lieu spécifique, consulter la compétence venue-templates pour les guides de style de rédaction :

Les différents lieux ont des attentes de rédaction radicalement différentes :

• Nature/Science : Accessible, piloté par l'histoire, signification large
• Cell Press : Profondeur mécaniste, graphiques abstraits, points saillants
• Revues médicales (NEJM, Lancet) : Résumés structurés, langage fondé sur les données probantes
• Conférences ML (NeurIPS, ICML) : Puces de contribution, études d'ablation
• Conférences CS (CHI, ACL) : Conventions spécifiques au domaine

La compétence venue-templates fournit :

• venue_writing_styles.md : Comparaison de style maître
• Guides spécifiques au lieu : nature_science_style.md, cell_press_style.md, medical_journal_styles.md, ml_conference_style.md, cs_conference_style.md
• reviewer_expectations.md : Ce que les relecteurs recherchent à chaque lieu
• Exemples de rédaction dans assets/examples/

Processus : D'abord utiliser cette compétence pour les principes généraux de rédaction scientifique (IMRAD, clarté, citations), puis consulter venue-templates pour l'adaptation du style spécifique au lieu.

Références

Cette compétence inclut des fichiers de référence complets couvrant des aspects spécifiques de la rédaction scientifique :

• references/imrad_structure.md : Guide détaillé du format IMRAD et du contenu spécifique aux sections
• references/citation_styles.md : Guides complets du style de citation (APA, AMA, Vancouver, Chicago, IEEE)
• references/figures_tables.md : Bonnes pratiques pour créer des visualisations de données efficaces
• references/reporting_guidelines.md : Normes de rapprochement spécifiques aux études et listes de contrôle
• references/writing_principles.md : Principes fondamentaux de la communication scientifique efficace
• references/professional_report_formatting.md : Guide du stylage des rapports professionnels avec scientific_report.sty

Ressources

Cette compétence inclut les packages de style LaTeX et les modèles pour le formatage professionnel des rapports :

• assets/scientific_report.sty : Package de style LaTeX professionnel avec polices Helvetica, boîtes colorées et tableaux attrayants
• assets/scientific_report_template.tex : Modèle de rapport complet démontrant toutes les fonctionnalités de style
• assets/REPORT_FORMATTING_GUIDE.md : Guide de référence rapide pour le package de style

Fonctionnalités clés de scientific_report.sty :

• Famille de polices Helvetica pour une apparence moderne et professionnelle
• Schéma de couleurs professionnel (bleus, verts, oranges, violets)
• Environnements de boîte : keyfindings, methodology, resultsbox, recommendations, limitations, criticalnotice, definition, executivesummary, hypothesis
• Tableaux avec couleurs alternées pour les lignes et en-têtes professionnels
• Commandes de notation scientifique pour les valeurs p, les tailles d'effet, les intervalles de confiance
• En-têtes et pieds de page professionnels

Pour les styles de rédaction spécifiques au lieu (ton, voix, format du résumé, attentes des relecteurs), voir la compétence venue-templates qui fournit des guides de style complets pour Nature/Science, Cell Press, revues médicales, conférences ML et conférences CS.

Charger ces références selon les besoins lors de la rédaction sur des aspects spécifiques de la rédaction scientifique.